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2026 年，台灣蛋白質新藥研發進入 自動化高通量時代。永豐餘學院捐贈的 eProtein Discovery 系統於台大與成功大學正式落地，可在 48 小時內完成 192 組 DNA 條件篩選，大幅縮短傳統研發週期。系統採用無細胞蛋白質表達與數位微流體技術，可即時生成蛋白產量、溶解度及純化潛力報告，幫助研究團隊快速篩選高潛力候選藥物。未來擴充功能包括抗體篩選、蛋白質交互作用研究與 ADC 藥物開發，將提升臨床成功率。導入台灣不僅讓學術研究對標劍橋、MIT 等國際機構，也為 CRO 與生技產業提供承接國際訂單的新契機，標誌台灣在蛋白質新藥領域進入黃金十年。

💊 蛋白質研發從數周縮至 48 小時！台大成大導入全球最強 eProtein 系統

📑 目錄

• 第一章： 引言：蛋白質新藥——生技產業的「聖盃」與時間挑戰

• 第二章： 📍 核心黑科技：Nuclera eProtein Discovery 的「無細胞」革命

• 第三章： 📍 台灣血統：元太科技 E Ink 數位微流體與生醫的完美跨界

• 第四章： 📍 數據領先：192 組高通量條件篩選，如何擊碎研發瓶頸？

• 第五章： 📍 國際戰略：接軌劍橋、哈佛、MIT，台灣在亞洲的研發定位

• 第六章： 📊 深度對照表：傳統細胞工廠 vs. 數位自動化表達系統

• 第七章： 📍 未來擴充性：抗體篩選與蛋白質交互作用的下一步佈局

• 第八章： 💡 專家觀點：台灣生技如何利用自動化實現「彎道超車」？

• 第九章： 結論：從學術研究到商業量產，蛋白質自動化的黃金十年

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🏗️ 第一章：引言：蛋白質新藥——生技產業的「聖盃」與時間挑戰

蛋白質藥物（包含單株抗體、重組蛋白、疫苗等）已佔據全球藥物市場的半壁江山。然而，蛋白質的結構極其複雜，稍有不慎就會產生折疊錯誤或失去活性。

在過去，研究員為了找到一個「能穩定產生且具功能」的蛋白，必須在實驗室裡與大腸桿菌或酵母菌搏鬥數月。這種高度依賴人工操作、重複性高且失敗率不穩定的流程，成了新藥開發前端最大的「堵點」。eProtein Discovery 的出現，正是為了將生技研究從「傳統農業模式」轉化為「工業自動化模式」。

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📍 第二章：核心黑科技：Nuclera eProtein Discovery 的「無細胞」革命

來自英國劍橋的新創公司 Nuclera，核心目標是讓科學家像使用印表機一樣「列印」蛋白質。

🧪 顛覆性的「無細胞（Cell-free）」技術

傳統方法需要將 DNA 轉殖進活細胞，等待細胞分裂、表達。而 eProtein Discovery 系統直接提取了蛋白質合成所需的「細胞機器」（如核糖體、酵素等），在體外環境進行合成。

• 不再等待細胞生長： 省去數天的細胞擴增時間。

• 克服毒性蛋白： 許多蛋白質對活細胞有毒，導致無法表達；無細胞系統則無此限制。

• 極高靈活性： 隨時調整反應緩衝液、輔因子，實現最佳折疊效果。

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📍 第三章：台灣血統：元太科技 E Ink 數位微流體與生醫的完美跨界

這項技術中最令人振奮的，是它整合了台灣的電子顯示技術。系統核心的微流體晶片由 元太科技 提供支援。

💡 數位微流體

想像一片佈滿電極的透明薄膜，每一滴比針尖還小的液滴，都能在電場的驅動下，像棋子一樣在晶片上精準移動。

• 微縮反應室： 每一組蛋白質表達都在微升等級的液滴中完成。

• 高度集成： 從 DNA 加入、試劑混合、反應溫控到最後的磁珠純化，全都在一片晶片上完成，無需人工移液。

• 電子紙技術的降維打擊： 元太科技將原本用於顯示器的薄膜電晶體（TFT）技術轉化為生物操控平台，這正是台灣「生物資通訊（Bio-ICT）」的終極體現。

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📍 第四章：數據領先：192 組高通量條件篩選，如何擊碎研發瓶頸？

⏱ 篩選速度的革命

傳統蛋白質篩選依賴人工操作，需要反覆轉殖、培養與純化，每一組條件都可能耗費數天至數週。對於 24 個 DNA 構件與 8 種表達條件，傳統實驗室可能需要三位研究生 整整一個月 才能完成。

而 eProtein Discovery 系統，結合數位微流體晶片與自動化控制，一次運行即可完成 192 組實驗，用時僅 48 小時。

💡 專家觀點：蛋白質新藥研發的核心，不是做對了幾次，而是「多快能排除錯誤方案」。速度即是競爭力。

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📊 核心數據輸出與決策支持

系統不僅產出蛋白，更自動生成關鍵數據：

系統透過 智慧篩選演算法，自動標註「高潛力蛋白質」，研究團隊可立即將資源集中於最有價值的候選藥物，節省人力與試劑成本。

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⚡ 高通量對研發策略的影響

1. 資源最優化：捨棄低潛力標靶，集中研發資源於明星候選藥物。

2. 縮短死亡谷期：高通量數據可提前排除臨床失敗風險高的蛋白質，提高候選藥物進入臨床的成功率。

3. 加速創新：短週期篩選與數據迭代，促進蛋白質設計、序列優化與結構修飾的快速循環。

🔬 實例觀察：某台灣藥廠使用該系統後，單一蛋白質的篩選週期由傳統 6 週縮短至 48 小時，候選藥物數量在同一季度提升了 3–4 倍。

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📍 第五章：國際戰略：接軌劍橋、哈佛、MIT，台灣在亞洲的研發定位

🌏 技術同步：拉平國際差距

導入 eProtein Discovery 系統 的台灣大學與成功大學，研究水準可直接對標劍橋、哈佛、MIT 及柏克萊。核心優勢包括：

• 硬體先進性：無細胞蛋白質表達、自動化篩選與數據生成

• 高通量能力：一次運行 192 組篩選，快速迭代實驗方案

• 數據精準性：即時生成蛋白產量、溶解度與純化報告，支撐決策

💡 專家觀點：過去亞洲學界常受限於設備，無法與頂尖學術機構同步進行高通量蛋白質篩選。此系統導入台灣後，實現 技術落差縮小、研究速度躍升。

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👩‍🔬 吸引國際人才

• 頂尖蛋白質科學家與生技工程師可 直接在台灣使用世界最先進設備

• 台灣的學術機構因此更具國際吸引力，將吸引外籍博士後、訪問學者及高端研發人才

• 人才集聚將進一步帶動 Bio-ICT 跨領域創新

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🏢 CRO 轉型機會

台灣的生技服務公司可導入此系統，承接更多國際藥廠的 高端早期研發訂單：

🔑 投資觀點：CRO 若能掌握此系統與數據分析能力，將成為 全球生技研發外包市場的新興黑馬。

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📊 第六章：深度對照表：傳統細胞工廠 vs. 數位自動化表達系統

比較維度	傳統細胞培養法 (In-vivo)	eProtein Discovery (DMF+Cell-free)
時間成本	2 ~ 8 週	24 ~ 48 小時
人工參與	高度依賴人工移液與監測	全自動化數位操控
失敗成本	發現失敗時已投入大量時間/培養基	極速反饋，損失可控
通量(一次性)	低 (通常 1-6 組)	極高 (192 組)
精準度	受生物變異影響較大	數位信號精準控制，重複性高
占地空間	需完整實驗室與大型設備	桌面型一體機

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📍 第七章：未來擴充性：抗體篩選與蛋白質交互作用的下一步布局

2026 年導入台灣的 eProtein Discovery 系統僅是開始，Nuclera 已經規劃下一步技術擴充：

🔬 抗體發現（Antibody Discovery）

• 系統可直接在微流體晶片上篩選 抗體與抗原結合親和力

• 篩選過程自動化，可完成 數百至數千組抗體篩選

• 對於 標靶藥物開發，尤其是癌症、感染病及自體免疫疾病藥物，效率提升數倍

🤝 蛋白質交互作用（PPI）

• PPI 是研究藥物如何影響 蛋白質間結合 的核心

• 系統可在微流體晶片中模擬蛋白質結合場景，測試藥物候選分子的干預效果

• 對開發「難成藥（Undruggable）」標靶具有重大價值

💊 ADC 藥物開發

• 可協助鑑定最適合連接 抗體與化療藥物 的蛋白載體結構

• 支援自動化分析與高通量篩選，縮短 ADC 藥物候選鑑定週期

• 與 AI 設計結合，提升精準性與成功率

💡 專家觀點：未來 3–5 年，抗體與 PPI 模組將是新藥研發成功率的重要關鍵，台灣有望利用自動化技術彎道超車。

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💡 第八章：專家觀點：台灣生技如何利用自動化實現「彎道超車」？

產業分析師提出三大策略觀點：

1️⃣ 研發資產價值的重估

• 過去台灣藥廠前端研發偏弱，專利價值利用不足

• 高通量系統導入後，研發週期縮短，專利保護期能充分利用

• 企業研發資產重新估值，提升國際投資吸引力

2️⃣ Bio-ICT 跨領域人才的紅利

• 台灣半導體工程師全球領先

• 當工程師與生醫研究結合，將開發更多 生醫硬體與高通量篩選系統

• 可望輸出至國際市場，形成台灣生技新產業鏈

3️⃣ 臨床成功率的顯著提升

• 高通量篩選能在 早期確認蛋白質穩定性與可溶性

• 進入臨床試驗的候選藥物風險降低

• 三期臨床失敗率可望下降，降低高額研發成本

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🏆 第九章：結論：從學術研究到商業量產，蛋白質自動化的黃金十年

• 2026 年，eProtein Discovery 系統落地台大與成大，標誌台灣進入 蛋白質自動化生產新紀元

• 學術界可加速論文產出，提升國際接軌

• 產業界可縮短新藥開發「死亡谷」，增加全球競爭力

• 高通量、自動化、數位微流體技術將成為 台灣蛋白質新藥的核心競爭力

🔑 生技產業的競爭本質是 效率與智慧的博弈。當台灣掌握數位微流體鑰匙，蛋白質新藥的大躍進才正要開始。

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